Еще раз
Делать замену намного удобнее в Subtitle Edit. Он выводит результаты в виде "до" и "после", там можно отключить то, что не нужно исправлять, или увидеть то, что нужно исправить как-то по-другому. Но он не понимает инструкцию \L$, и не только ее, поэтому пришлось писать по 2 правила замены на каждую гласную. Громоздко, но работает, по крайней мере.
Переписать выражение, чтобы игнорировало слова полностью в верхнем регистре... :
Во втором сообщении темы написана строка поиска и замены которая работает в Sublime Text 3. Если Notepad++ 7.5.6 понимает инструкцию \L$, то и в нем она сработает.